Министерство в своей работе отчитывается перед Главой Республики Калмыкия, Правительством Республики Калмыкия.
Министерство возглавляет Министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Главой Республики Калмыкия.
Министр экономики Республики Калмыкия несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство функций.
Министр экономики Республики Калмыкия имеет заместителей, назначаемых на должность и освобождаемых от должности по его представлению Главой Республики Калмыкия.
Министр экономики Республики Калмыкия:
- руководит деятельностью Министерства, обеспечивает выполнение стоящих перед Министерством задач;
- распределяет обязанности между заместителями;
- издает в пределах своей компетенции приказы;
- назначает и освобождает от должности работников Министерства; представляет работников Министерства, иных лиц
- представляет в установленном порядке работников Министерства и других лиц, осуществляющих деятельность в установленной сфере, к присвоению почетных званий и награждению государственными наградами Республики Калмыкия, Российской Федерации;
- осуществляет иные полномочия в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Калмыкия.
Структура и штатное расписание Министерства экономики Республики Калмыкия утверждается Министром экономики Республики Калмыкия в пределах, установленных Правительством Республики Калмыкия фонда оплаты труда и численности работников.
Министерство экономики Республики Калмыкия является юридическим лицом, имеет расчетные и иные счета в учреждениях банков, печать с изображением Государственного герба Республики Калмыкия и со своим наименованием на 2-х языках (русском и калмыцком).
Министерство экономики Республики Калмыкия имеет обособленное имущество и основные средства.