Контроль за выполнением Государственный комплексной программы повышения плодородия почв осуществляется Министерством сельского хозяйства и продовольствия Республики Северная Осетия-Алания, Земельным комитетом Республики Северная Осетия-Алания, межведомственным консультативным советом по контролю за реализацией Программы, федеральным государственным учреждением "Станция агрохимической службы "Северо-Осетинская", органами исполнительной власти в районах.
Система контроля предусматривает:
контроль за происходящими изменениями агроэкологических показателей в почве в связи с реализацией мероприятий, предусмотренных Программой;
ежеквартальную отчетность органов управления агропромышленным комплексом Республики Северная Осетия-Алания Министерству сельского хозяйства и продовольствия Республики Северная Осетия-Алания и Министерству сельского хозяйства Российской Федерации;
систематическое обсуждение хода выполнения Программы на межведомственном консультативном совете по контролю за реализацией Программы.