Контроль за реализацией Программы осуществляет администрация Калининградской области через Главное контрольное управление администрации области, управление государственной службы и подготовки кадров администрации области и управление по взаимодействию с органами местного самоуправления администрации области.
Текущая информация и ежегодные доклады о выполнении Программы и об использовании выделенных средств представляются исполнителями Программы в установленные сроки.