Регламент Счетной палаты утверждается ее Коллегией. Им определяются вопросы внутренней деятельности Счетной палаты, распределение обязанностей между аудиторами, функции и взаимодействие структурных подразделений аппарата Счетной палаты, порядок ведения дел, подготовки, проведения мероприятий всех видов и форм контрольной и иной деятельности.