Основными функциями Минприроды PC(Я) являются:
3.1. Разработка и совершенствование нормативных правовых актов Республики Саха (Якутия) в области охраны окружающей среды, содержащих требования, нормы и правила не ниже установленных на федеральном уровне и учитывающих региональную специфику территории республики.
3.2. Формирование и обеспечение функционирования территориальных систем экологического мониторинга окружающей среды за состоянием окружающей среды на территории Республики Саха (Якутия).
3.3. Организация и развитие системы экологического просвещения и формирования экологической культуры населения.
3.4. Организация реализации Соглашений между Правительством Российской Федерации и Правительством Республики Саха (Якутия), а также между Правительствами субъектов Российской Федерации и органами местного самоуправления в области использования природных ресурсов и охраны окружающей среды.
3.5. Организация и осуществление до 1 января 2006 года государственного экологического контроля в области охраны окружающей среды (государственный экологический контроль) за объектами хозяйственной и иной деятельности, независимо от форм собственности, находящимися на территории республики, за исключением объектов хозяйственной и иной деятельности, подлежащих федеральному государственному экологическому контролю.
3.6. Охрана объектов животного мира, отнесенных к объектам охоты, за исключением объектов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения.
3.7. Регулирование использования, воспроизводства, учета и кадастра объектов животного мира, отнесенных к объектам охоты, за исключением объектов, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения, перечень которых определяется Правительством Российской Федерации (уполномоченным федеральным органом исполнительной власти).
3.8. Выдача именных разовых и распорядительных лицензий на использование объектов животного мира, отнесенных к объектам охоты, в пределах установленной компетенции.
3.9. Регулирование промышленного, любительского и спортивного рыболовства, за исключением ресурсов внутренних морских вод, территориального моря, континентального шельфа и исключительной экономической зоны Российской Федерации.
3.10. Охрана водных биологических ресурсов на внутренних водных объектах, за исключением особо охраняемых природных территорий федерального значения и пограничных зон.
3.11. Распределение квот добычи (вылова) водных биоресурсов для организации любительского и спортивного рыболовства между пользователями водными биоресурсами, в том числе в целях обеспечения традиционного образа жизни и осуществления традиционной хозяйственной деятельности коренных малочисленных народов Севера.
3.12. Ведение Красной книги Республики Саха (Якутия) в целях охраны и учета редких и находящихся под угрозой исчезновения растений, животных и других организмов.
3.13. Осуществление в пределах своей компетенции координации деятельности физических и юридических лиц в области охраны атмосферного воздуха, не отнесенных к федеральным полномочиям.
3.14. Обеспечение населения достоверной информацией о состоянии окружающей среды на территории республики.
3.15. Контроль за обеспечением радиационной безопасности населения и окружающей среды на территории республики.
3.16. Осуществление учета и контроля радиоактивных веществ на территории республики в рамках системы государственного учета и контроля радиоактивных веществ.
3.17. Участие в организации и проведении оперативных мероприятий в случае угрозы возникновения радиационной аварии.
3.18. Организация обеспечения физической защиты радиационных источников, радиоактивных веществ и не содержащих ядерных материалов радиоактивных отходов, находящихся в собственности Республики Саха (Якутия).
3.19. Участие в обеспечении защиты граждан и охраны окружающей среды от радиационного воздействия, превышающего установленные нормами и правилами в области использования атомной энергии пределы.
3.20. Ведение государственного учета объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду.
3.21. Контроль за осуществлением органами местного самоуправления отдельных государственных полномочий в области охраны окружающей среды, а также за использованием предоставленных на эти цели материальных ресурсов и финансовых средств из бюджета республики.
3.22. Оказание методической помощи органам местного самоуправления в разработке модельных муниципальных нормативных актов, связанных с реализацией вопросов охраны окружающей среды, определенных федеральным и республиканским законодательством.
3.23. Развитие системы экологического просвещения, участие в формировании экологической культуры населения республики и координация в этой области деятельность других министерств и ведомств.
3.24. Организация научного обеспечения и осуществление координации работ, связанных с решением проблем в области охраны окружающей природной среды, регулирования природопользования и соблюдения норм экологической безопасности.
3.25. Участие в международном сотрудничестве в области охраны окружающей среды в соответствии с общепризнанными принципами и нормами международного права и международными договорами Российской Федерации в области охраны окружающей среды.
3.26. Оказание содействия гражданам, общественным и иным некоммерческим объединениям в реализации их прав в области охраны окружающей среды.
3.27. Создание и обеспечение функционирования экологических информационных систем и баз данных.
3.28. Подготовка и выпуск ежегодного государственного доклада о состоянии окружающей среды в Республике Саха (Якутия), участие в подготовке ежегодного государственного доклада о состоянии окружающей среды в Российской Федерации.