1. По комплексности охвата проблем областные программы могут подразделяться на программы социально-экономического развития Магаданской области и областные целевые программы.
2. Областные целевые программы могут подразделяться на социальные, экономические, культурные, природно-ресурсные и другие. Конкретное направление областной целевой программы кратко отражается в ее названии.
3. По широте территориального охвата областные программы подразделяются на программы, реализуемые на всей территории Магаданской области, и программы, реализуемые на территории одного или нескольких муниципальных образований Магаданской области. Областная программа может входить составной частью в региональную или федеральную целевую программу, реализуемую на территории Магаданской области и Дальневосточного региона.
4. По срокам реализации областные программы подразделяются на краткосрочные (один год) и долгосрочные (два года и более).
5. Областная программа может включать в себя одну или несколько подпрограмм, направленных на решение конкретных задач в рамках областной программы. Деление областной программы на подпрограммы осуществляется исходя из масштабности и сложности решаемых проблем, а также необходимости рациональной организации их реализации.