Основными задачами Министерства являются:
2.1. Обеспечение реализации конституционных прав граждан Российской Федерации на гарантированное получение медицинской помощи, лекарственных средств, изделий медицинского назначения.
2.2. Реализация государственной политики и государственного управления в области здравоохранения, лекарственного обеспечения, санаторно-курортного дела.
2.3. Обеспечение населения своевременной, доступной, качественной и эффективной медицинской помощью, в том числе в условиях чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера, а также во время ведения военных действий.
2.4. Организация и развитие системы управления качеством медицинской помощи.
2.5. Развитие и модернизация системы здравоохранения в Республике Хакасия.