Контроль за целевым использованием средств осуществляет администрация Ненецкого автономного округа, а также иные органы государственной власти в рамках их компетенции.
За нецелевое использование средств получатели субсидий, субвенций и бюджетных кредитов несут ответственность в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации (абзац в редакции, введенной в действие с 30 декабря 2006 года Законом Ненецкого автономного округа от 28 декабря 2006 года N 832-оз, - см. предыдущую редакцию).