Управление реализацией Программы осуществляет министерство сельского хозяйства и продовольствия Ростовской области, являющееся заказчиком-координатором Программы.
Министерство сельского хозяйства и продовольствия Ростовской области:
обеспечивает совместно с министерствами Ростовской области - заказчиками Программы согласованность действий по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств федерального бюджета, финансированию программных мероприятий за счет средств областного бюджета, местных бюджетов и внебюджетных источников;
Одновременно с отчетом об исполнении областного бюджета за соответствующий финансовый год Администрация Ростовской области ежегодно представляет в Законодательное Собрание Ростовской области и Контрольно-счетную палату Ростовской области отчет о реализации в отчетном финансовом году Целевой программы.