Взаимодействие между координаторами подпрограмм осуществляет главный координатор - департамент социальной защиты населения администрации области.
Текущее управление реализацией Программы осуществляется межведомственным координационным советом, созданным распоряжением губернатора области и рабочими группами каждой подпрограммы, созданными приказами по соответствующим департаментам.
Контроль за реализацией Программы осуществляется департаментом социальной защиты населения администрации области, департаментом образования и науки администрации области и департаментом здравоохранения администрации области совместно с департаментом финансов администрации области.
Департамент социальной защиты населения администрации области совместно с координаторами подпрограмм осуществляет подготовку и представление справочно - аналитической информации и ежегодных докладов о ходе реализации мероприятий Программы и эффективности использования финансовых средств в администрацию области.