Организация инновационной деятельности осуществляется на основе сочетания принципов самоорганизации субъектов инновационной деятельности и государственного регулирования в пределах, не нарушающих свободу научного и иного творчества, признанного инновационным.
Самоорганизация определяет характер отношений между различными субъектами инновационной деятельности с целью повышения эффективности осуществления инновационной деятельности.
Государственное регулирование определяет правовые и организационные отношения органов государственной власти и субъектов инновационной деятельности через уполномоченный орган в интересах социально-экономического развития Волгоградской области.