В целях охраны уникальной экологической системы Телецкого озера и предотвращения негативного воздействия хозяйственной и иной деятельности на ее состояние устанавливается его водный режим, сохраняющий режим притока и стока озера, а также водопользование.
Водный режим определяется территориальным федеральным органом управления, использования и охраны водного фонда Российской Федерации.