Глава Республики Алтай, Председатель Правительства может отправить в отставку Правительство Республики Алтай, отдельных его членов, а также принимать добровольную отставку Правительства.
Государственное Собрание - Эл Курултай вправе выразить недоверие Правительству Республики Алтай или отдельным членам Правительства, при назначении которых на должность оно давало согласие. Принятие решения о недоверии указанным должностным лицам влечет немедленное освобождение их от должности (часть в редакции, введенной в действие постановлением Государственного Собрания - Эл Курултай Республики Алтай от 26 апреля 2001 года N 21-45, - см. предыдущую редакцию).
В случае отставки Правительства или выражения ему недоверия, а также отдельным членам Правительства Глава Республики Алтай, Председатель Правительства формирует Правительство Республики Алтай в порядке, установленном настоящим Регламентом, Законом Республики Алтай "О Государственном Собрании - Эл Курултай Республики Алтай" и Законом Республики Алтай "О Правительстве Республики Алтай".