Правительство Республики Алтай:
1) утверждает Программу развития образования, Концепции национальных школ Республики Алтай, заслушивает информацию Министерства образования и науки Республики Алтай;
2) формирует проект республиканского бюджета в части расходов на образование и представляет его на утверждение в Госсобрание - Эл Курултай и обеспечивает его выполнение;
3) выступает с инициативой по введению налоговых льгот на развитие образования;
4) определяет меры по выполнению финансирования региональной программы развития образования в республике, обеспечению материально - технического снабжения учреждений образования;
5) устанавливает порядок формирования и расходования республиканского внебюджетного фонда развития образования;
6) устанавливает контроль за выполнением национально - региональных государственных образовательных стандартов;
7) принимает решение о создании, реорганизации и ликвидации образовательных учреждений республиканского подчинения, выступает с инициативой об организации, ликвидации и реорганизации высших учебных заведений на территории Республики Алтай;
8) определяет в пределах своей компетенции разграничение полномочий и предметов ведения в области образования путем двухстороннего принятия Соглашения (договора) между Министерством образования Российской Федерации и Правительством Республики Алтай;
9) обеспечивает соблюдение и реализацию законодательства Российской Федерации и Республики Алтай в области образования;
10) представляет Главе Республики Алтай к присвоению государственных наград и почетных званий работников образования Республики Алтай;
11) формирует республиканский государственный орган управления образованием в структуре Правительства Республики Алтай по согласованию с Государственным Собранием - Эл Курултай Республики Алтай;
12) В целях подготовки и закрепления кадров в сельской местности устанавливает квоту приема выпускников сельских общеобразовательных школ путем заключения контрактов с образовательными учреждениями республики, реализующими программы среднего и высшего профессионального образования.