Правительство Республики Алтай:
- определяет и представляет на утверждение в Государственное Собрание - Эл Курултай Республики Алтай приоритетные направления и основные положения научно-технической политики РА;
- обеспечивает разработку, экспертизу и финансирование республиканских научно-технических программ;
- создает республиканский фонд (включая инновационный) поддержки науки и высшего образования;
- создает, реорганизовывает и ликвидирует научные организации и учреждения республиканского уровня;
- утверждает уставы научных организаций, учредителем которых оно является;
- на конкурсной основе утверждает руководителей государственных научных организаций по контракту сроком до 5 лет;
- осуществляет контроль за использованием и сохранностью предоставленного научным организациям имущества, бюджетных финансовых средств;
- осуществляет аттестацию и аккредитацию юридических лиц научной и (или) научно-технической деятельности республиканского статуса;
- поддерживает информационную систему в сфере науки;
- утверждает структуру республиканских научных организаций;
- обеспечивает необходимую материально-техническую базу республиканских научных организаций и социально-экономические условия труда их сотрудников.