5.1. Руководство главным управлением осуществляет начальник главного управления Администрации области.
5.2. Начальник главного управления назначается на должность и освобождается от должности Главой Администрации (Губернатором) области по представлению заместителя Главы Администрации (Губернатора) области по организационной, кадровой работе и вопросам местного самоуправления.
5.3. Начальник главного управления:
представляет Главе Администрации (Губернатору) области на утверждение Положение о главном управлении, его структуру и штатную численность;
вносит предложения о назначении и освобождении начальников подразделений и других работников главного управления, поощрении работников и наложении на них дисциплинарных взысканий;
решает вопросы командирования работников главного управления;
участвует в работе заседаний коллегии Администрации области;
в рамках своей компетенции представляет главное управление во взаимоотношениях с областными органами исполнительной власти, органами местного самоуправления, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, расположенными на территории области, подразделениями Администрации Президента Российской Федерации и Правительством Российской Федерации.
5.4. В период временного отсутствия начальника главного управления руководство управлением осуществляет заместитель начальника главного управления - начальник отдела инспектирования.