Управление реализацией Программы осуществляется департаментом здравоохранения администрации области.
Объем финансирования мероприятий Программы за счет средств областного бюджета ежегодно подлежит уточнению в установленном порядке при формировании проекта областного бюджета.
Департамент здравоохранения администрации области, управление исполнения наказаний Министерства юстиции Российской Федерации по Костромской области ежеквартально в установленном порядке направляют информацию о ходе реализации Программы и эффективности использования финансовых средств в департамент по экономике и экономическим реформам и департамент финансов администрации области.