Предоставление лицензий осуществляется через государственную систему лицензирования.
Организационное обеспечение государственной системы лицензирования на территории Республики Алтай осуществляют федеральный орган управления государственным фондом недр и его территориальный орган в Республике Алтай (Комитет природных ресурсов по Республике Алтай).
Федеральный орган управления государственным фондом недр и Комитет природных ресурсов по Республике Алтай осуществляют подготовительную работу, связанную с проведением конкурсов (аукционов) и предоставлением лицензий, согласовывает условия лицензии с государственными органами управления промышленностью, земельными, водными и лесными ресурсами, государственными органами охраны окружающей природной среды, органами государственного горного надзора, а в части, касающейся платы, - с государственными органами управления экономикой. В случаях, установленных законодательством Российской Федерации, условия пользования участками недр должны быть согласованы с федеральным органом исполнительной власти по обороне и федеральным органом исполнительной власти по безопасности.
При предоставлении лицензии на бесконкурсной основе все виды согласований проводятся совместно с потенциальным пользователем недр.
Оформление, государственная регистрация и выдача лицензий на пользование недрами осуществляются федеральным органом управления государственным фондом недр или его территориальным органом.
Порядок лицензирования пользования участками недр устанавливается федеральным законом.