В компетенцию Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай в сфере регулирования отношений недропользования входит:
1) принятие и совершенствование законов и иных нормативных правовых актов Республики Алтай в области недропользования в пределах своих полномочий;
2) распоряжение совместно с органами государственной власти Российской Федерации государственным фондом недр на территории Республики Алтай и выделение совместно с Российской Федерацией участков недр федерального, регионального и местного значения;
3) защита интересов малочисленных народов, прав пользователей недр и интересов граждан, проживающих в Республике Алтай;
4) рассмотрение и утверждение финансирования из бюджета Республики Алтай территориальной программы развития минерально-сырьевой базы;
5) установление порядка получения права пользования участками недр, содержащих месторождения общераспространенных полезных ископаемых или имеющих местное значение, а также участками недр местного значения, используемых для целей, не связанных с добычей полезных ископаемых;
6) установление дополнительных оснований для освобождения отдельных категорий пользователей недр от платежей, поступающих в бюджет республики;
7) регламентирование использования отчислений на воспроизводство минерально-сырьевой базы, поступающих в бюджет республики;
8) осуществление иных полномочий, предусмотренных законодательством.
В компетенцию Правительства Республики Алтай входит:
1) установление по представлению территориального органа в области управления государственным фондом недр размеров платы за пользование участками недр регионального и местного значения в установленных пределах;
2) определение совместно с федеральным органом управления государственным фондом недр или его территориальным органом, по согласованию с соответствующими федеральными органами исполнительной власти, порядка и условий проведения конкурсов или аукционов на право пользования участками недр;
3) предоставление совместно с федеральным органом управления государственным фондом недр или территориальным органом по результатам конкурса или аукциона лицензий на право пользования участками недр для цели разведки и добычи полезных ископаемых на участках недр, расположенных на территории республики.
4) предоставление совместно с территориальным органом федерального органа управления государственным фондом недр в пользование участков недр местного значения, а также участков недр местного значения, используемых для целей, не связанных с добычей полезных ископаемых а порядке, установленном Государственным Собранием-Эл Курултай Республики Алтай;
5) согласование решения федерального органа управления государственным фондом недр или его территориального органа о предоставлении участков недр для геологического изучения;
6) согласование решения Правительства Российской Федерации о предоставлении участков недр для целей захоронения радиоактивных, токсичных и иных опасных отходов в глубоких горизонтах, обеспечивающих локализацию таких отходов;
7) утверждение и реализация в пределах своих полномочий территориальных программ геологического изучения недр, развития и освоения минерально-сырьевой базы Республики Алтай;
8) определение порядка использования отчислений на воспроизводство минерально-сырьевой базы, аккумулируемых в бюджете Республики Алтай;
9) осуществление представления о направлении в бюджет Республики Алтай части отчислений на воспроизводство минерально-сырьевой базы, в том числе всех отчислений, производимых при добыче общераспространенных полезных ископаемых и подземных вод, используемых для местных нужд, для целевого финансирования работ по производству минерально-сырьевой базы в соответствии с территориальными программами геологического изучения недр;
10) участие в пределах своих полномочий в соглашениях о разделе продукции при пользовании участками недр;
11) представление совместно с федеральным органом управления государственным фондом недр или его территориальным органом отсрочек или освобождения от платежей за пользование недрами, а также скидки за истощение недр пользователем недр, осуществляющим свою деятельность на основании лицензии, выданной с участием Правительства Республики Алтай;
12) определение форм и установление размеров платы за пользование участками недр регионального и местного значения в установленных пределах;
13) участие в государственной экспертизе информации о разведанных запасах полезных ископаемых и свойствах, определяющих их ценность или опасность;
14) составление территориальных балансов запасов и кадастров месторождений и проявлений полезных ископаемых и учет участков недр, используемых для строительства подземных сооружений, не связанных с добычей полезных ископаемых;
15) регулирование других вопросов в области недропользования в пределах своих полномочий.
Реализацию региональной политики недропользования в Республике Алтай осуществляет Правительство Республики Алтай и территориальный орган федерального органа управления государственным фондом недр под контролем Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай.