Основными задачами в области водного хозяйства являются:
реализация Территориальной целевой программы "Обеспечение населения Республики Мордовия питьевой водой";
осуществление координации работы по реализации Федеральной программы "Вода России - 21 век";
выполнение Федеральной целевой программы "Возрождение Волги";
строительство и реконструкция очистных сооружений в городах, районных центрах;
проведение противоэрозионных мероприятий на реке Суре у озера Инерка Большеберезниковского района и на реке Мокше в г. Темникове;
организация и проведение работ на гидротехнических сооружениях, обеспечивающих их безопасную эксплуатацию;
ведение государственного мониторинга поверхностных водных объектов;
разработка и реализация противопаводковых мероприятий на территории республики;
увеличение мощности систем оборотного и повторного водоснабжения на промышленных предприятиях.