Государственный заказчик Программы - агентство главного распорядителя средств бюджета Калининградской области - является главным распорядителем выделенных на реализацию Программы бюджетных средств и обеспечивает их использование в соответствии с утвержденными программными мероприятиями.
Выбор исполнителей по мероприятиям Программы проводится на конкурсной основе, если иное не установлено действующим законодательством. Конкурсы проводятся конкурсным агентством Калининградской области в установленном законодательством порядке.
Для подготовки к проведению конкурсов министерство сельского хозяйства и рыболовства Калининградской области совместно с Управлением Федеральной службы исполнения наказаний Российской Федерации по Калининградской области осуществляют сбор и подготовку необходимых документов, представляет их в конкурсное агентство Калининградской области.
Выполнение мероприятий Программы осуществляется на условиях государственных контрактов, заключаемых государственным заказчиком Программы - агентством главного распорядителя средств бюджета Калининградской области, министерством сельского хозяйства и рыболовства Калининградской области и победителем соответствующего конкурса.