Основными источниками финансирования Программы являются средства федерального и краевого бюджетов.
Средства федерального бюджета (субсидии на поддержку садоводства) направляются на закладки новых насаждений плодовых и ягодных культур и проведение уходных работ за молодыми насаждениями. Потребность в средствах федерального бюджета на эти цели составляет ежегодно не менее 15 млн. руб., всего - 112,1 млн. руб. (таблица 12). Кроме того, на общих основаниях специализированные садоводческие хозяйства получают субсидии из федерального бюджета на приобретение минеральных удобрений и средств защиты растений отечественного производства в сумме от 0,8 до 1,1 млн. руб. ежегодно, всего - 7,4 млн. руб.
Средства краевого бюджета в сумме 6 млн. руб. ежегодно предполагается направлять на проведение работ по раскорчевке старовозрастных и списанных насаждений в хозяйствах, создание школьных садов, научное обеспечение программы, авансирование с целью удешевления посадочного материала.
Финансирование мероприятий по развитию садоводческих некоммерческих объединений граждан осуществляется за счет средств краевого и муниципальных бюджетов и составляет 68,9 млн.рублей ежегодно (таблица 13).