При определении квоты министерства, ведомства, администрации районов и г. Горно-Алтайска создают комиссии по отбору кандидатов для целевого набора в высшие учебные заведения и объявляют конкурс. Преимущественным правом для участия в конкурсе по целевому набору пользуются выпускники сельских школ, имеющие в аттестате хорошие и отличные оценки, победители республиканских и межрегиональных школьных Олимпиад, конкурсов и фестивалей, а также выпускники с дипломами отличия учреждений начального профессионального образования и среднего специального образования текущего года выпуска. При отборе кандидатов по целевому набору предпочтение отдается одаренным детям, отличникам учебы из малоимущих семей.
Количество выпускников, направляемых на выделенные целевые места, для районов и города составляет не менее 2 и не более 3 человек на одно место.