В 2002 году:
1. Республиканская больница
2. Республиканская детская больница
3. Республиканская стоматологическая поликлиника
4. Республиканский центр по борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями
5. Республиканский кожно-венерологический диспансер
6. Республиканский трахоматозный диспансер
7. Республиканский эндокринологический диспансер
8. Муниципальная стоматологическая поликлиника
9. Городской родильный дом
10. Майминская центральная районная больница
11.Чойская центральная районная больница
12. Турачакская центральная районная больница
13. Чемальская центральная районная больница
14. Шебалинская центральная районная больница
15. Онгудайская центральная районная больница
16. Усть-Канская центральная районная больница
17. Усть-Коксинская центральная районная больница
18. Акташская межрайонная больница
19. Улаганская центральная районная больница
20. Кош-Агачская центральная районная больница