Финансирование мероприятий Программы осуществляется через государственного заказчика. Государственный заказчик содействует своевременному и полному обеспечению финансовыми ресурсами программных мероприятий в пределах установленного бюджетного и внебюджетного финансирования, координирует использование финансовых средств.
Финансирование Программы осуществляется за счет средств областного экологического фонда.