Контрольно-счетная палата строит свою работу на основе годовых и текущих планов, которые формируются исходя из необходимости обеспечения всестороннего системного контроля за исполнением окружного бюджета с учетом всех видов и направлений деятельности контрольно-счетной палаты. Годовые планы работы контрольно-счетной палаты утверждаются окружным Собранием депутатов. Текущие планы работы составляются начальником контрольно-счетной палаты и утверждаются председателем Собрания депутатов. Проект годового плана представляется начальником контрольно-счетной палаты не позднее чем за 30 дней до начала финансового года (абзац в редакции, введенной в действие с 24 апреля 2006 года Законом Ненецкого автономного округа от 21 апреля 2006 года N 700-оз, - см. предыдущую редакцию).
Обязательному включению в план работы контрольно-счетной палаты подлежат поручения окружного Собрания, а также обращения групп депутатов численностью не менее одной пятой от общего числа. Обязательному рассмотрению при формировании планов и программ работы подлежат запросы органов государственной власти и местного самоуправления.
Внеплановые контрольные мероприятия проводятся на основании решений окружного Собрания.
Информация о результатах проводимых контрольных мероприятий представляется контрольно-счетной палатой в Собрание депутатов ежеквартально до 15 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, а по итогам работы за год представляется отчет до 20 января следующего за отчетным года (абзац дополнительно включен с 24 апреля 2006 года Законом Ненецкого автономного округа от 21 апреля 2006 года N 700-оз).