Взаимоотношения республиканского бюджета Республики Саха (Якутия) с федеральным бюджетом определяются в соответствии с "Договором о разграничении предметов ведения и полномочий между федеральными органами государственной власти Российской Федерации и органами власти суверенных республик в составе Российской Федерации", "Соглашением о взаимоотношениях между правительствами Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) по экономическим вопросам" от 31 марта 1992 г. и ежегодно заключаемыми ими соглашениями о бюджетных взаимоотношениях, учитывающих республиканские Республики Саха (Якутия) и федеральные программы.