11. Агентство возглавляет руководитель Агентства, назначаемый на должность и освобождаемый от должности правовым актом Губернатора автономного округа по представлению заместителя Губернатора автономного округа, координирующего и контролирующего деятельность Агентства.
Руководитель Агентства несёт персональную ответственность за выполнение возложенных на Агентство полномочий и реализацию функций в установленной сфере деятельности.
Руководитель Агентства имеет заместителей, один из которых - первый заместитель руководителя, который осуществляет свою деятельность на освобождённой основе и исполняет обязанности руководителя при его временном отсутствии.
Первый заместитель руководителя Агентства назначается на должность и освобождается от должности правовым актом Губернатора автономного округа по представлению руководителя Агентства, согласованному с заместителем Губернатора автономного округа, координирующего и контролирующего деятельность Агентства.
Правовые акты и документы (приказы о заключении служебных контрактов на определённый срок, служебные контракты на определённый срок, командировочные удостоверения, иные документы) по вопросам осуществления трудовых отношений с руководителем Агентства и первым заместителем руководителя Агентства от имени представителя нанимателя подписывает руководитель аппарата Губернатора автономного округа.
12. Заместитель руководителя Агентства назначается на должность и освобождается от должности руководителем Агентства. Заместитель руководителя Агентства непосредственно руководит управлением Агентства.
13. Структурными подразделениями Агентства являются управление, отделы и сектор по основным направлениям деятельности Агентства.
14. Руководитель Агентства:
14.1. Распределяет обязанности между своими заместителями.
14.2. Вносит на утверждение Администрации автономного округа проект положения об Агентстве, состав основных структурных подразделений и предложения по штатной численности, а также смету расходов на его содержание.
14.3. Утверждает положения об основных структурных подразделениях Агентства и должностные регламенты государственных гражданских служащих Агентства.
14.4. Решает в соответствии с законодательством Российской Федерации, автономного округа о государственной службе вопросы, связанные с прохождением государственной гражданской службы в Агентстве.
14.5. Издаёт приказы по вопросам деятельности Агентства.
14.6. Распоряжается финансовыми средствами в пределах утверждённой сметы расходов на содержание Агентства.
14.7. Подписывает и визирует документы в соответствии с компетенцией Агентства.
14.8. Заключает договоры, контракты, соглашения в соответствии с компетенцией Агентства.
14.9. Вносит в установленном порядке на рассмотрение Губернатора и Администрации автономного округа проекты нормативных правовых актов, мероприятий, перспективных и текущих планов по вопросам, относящимся к деятельности Агентства.
14.10. Представляет в Администрацию автономного округа в установленном порядке предложения о создании, реорганизации и ликвидации государственных учреждений, находящихся в ведении Агентства.
14.11. Представляет в установленном порядке государственных гражданских служащих Агентства и иных лиц, осуществляющих деятельность в жилищной сфере, к присвоению почётных званий и награждению государственными наградами автономного округа.
14.12. Осуществляет иные полномочия в соответствии с законодательством Российской Федерации и нормативными правовыми актами автономного округа.