Задачами управления в сфере охраны и использования особо охраняемых природных территорий являются:
- реализация Ямало-Ненецким автономным округом своих правомочий по совместному с Российской Федерацией ведению особо охраняемых природных территорий, а также правомочий собственника природных ресурсов;
- организация выполнения особо охраняемыми природными территориями возложенных на них задач и функций;
- обеспечение режима законности на особо охраняемых природных территориях.