Правовое регулирование отношений, связанных с ведением рыбного хозяйства, базируется на следующих принципах:
- ведения рыбного хозяйства на основе оптимального сочетания экологических, экономических, научных и иных интересов;
- сохранения видового разнообразия рыб при ведении рыбного хозяйства, установления режима использования рыбных запасов в рыбохозяйственных водоемах на основании научных рекомендаций;
- недопустимости совмещения функций государственного управления и контроля в области ведения рыбного хозяйства с деятельностью по использованию рыбных ресурсов;
- устойчивости права пользования рыбохозяйственными ресурсами;
- платности пользования рыбохозяйственными ресурсами;
- ограничения в интересах охраны рыбных запасов прав других пользователей рыбохозяйственными водоемами в соответствии с действующим законодательством;
- взаимного согласования вопросов охраны и использования рыбохозяйственных ресурсов между федеральными органами исполнительной власти и администрацией автономного округа;
- использования экономического механизма охраны и использования рыбохозяйственных ресурсов;
- обязательности государственной экологической экспертизы хозяйственной и иной деятельности, оказывающей влияние на рыбохозяйственные ресурсы;
- сочетания интересов коренных малочисленных народов Севера и этнических общностей , всего населения автономного округа и Российской Федерации;
- участия субъектов рыбохозяйственной деятельности в проведении мероприятий по восстановлению используемых ими рыбохозяйственных ресурсов;
- гласности и связи с общественными объединениями и населением при ведения рыбного хозяйства;
- полного возмещения вреда, причиняемого ихтиофауне и водоемам организациями и гражданами;
- отделения права пользования рыбными ресурсами от права пользования водными объектами.