Механизм реализации направления подпрограммы, включая организацию управления и контроль за ходом его реализации, соответствует в целом механизму реализации Программы.
Ежегодно минздрав РО производит анализ и обобщение заявок муниципальных образований на иммунобиологические препараты для проведения вакцинопрофилактики природно-очаговых, особо опасных инфекционных болезней, формирует сводную бюджетную заявку, обеспечивает согласование с Управлением Роспотребнадзора по Ростовской области, проводит торги по закупкам иммунобиологических препаратов и заключает договор с организацией, осуществляющей хранение, распределение, учет и выдачу медицинских иммунобиологических препаратов муниципальным образованиям (складом медицинских иммунобиологических препаратов).
Отчеты о движении иммунобиологических препаратов направляются ежемесячно в управление лечебно-профилактической помощи (по количественным показателям) и в отдел бухгалтерского учета и отчетности (по финансовым показателям) минздрава области. Отчеты о получении и использовании иммунобиологических препаратов представляются муниципальными образованиями ежегодно.