2.1. Группа организационно-штатной работы.
2.2. Юридическая служба.
2.3. Группа по организации мобилизационной подготовки и гражданской обороны.
2.4. Экспертная группа по вопросам безопасности.
2.5. Отдел (отделение, группа) собственной безопасности.
2.6. Отдел документационного обеспечения и архивной работы (секретариат).
2.7. Служба (группа) по защите государственной тайны.
2.8. Контрольно-ревизионный отдел (отделение, группа).
2.9. Регионально-аналитическая группа (создается в УФСИН России по Ставропольскому краю, г.Москве, г.Санкт-Петербургу и Ленинградской области).
2.10. Организационно-аналитический отдел (отделение).
2.11. Пресс-служба.
2.12. Ветеринарная служба.
2.13. Кустовая инспекция технического надзора (создается в территориальных органах ФСИН России, осуществляющих функции по федеральному государственному надзору в области промышленной безопасности в отношении опасных производственных объектов уголовно-исполнительной системы).
2.14. Оперативное управление (отдел, отделение).
2.15. Отдел (отделение) режима и надзора.
2.16. Отдел (отделение, группа) организации исполнения наказаний, не связанных с изоляцией осужденных от общества.
2.16(1). Отдел (отделение, группа) исполнительной и постпенитенциарной пробации.
(Пункт дополниительно включен с 27 октября 2023 года приказом ФСИН России от 20 сентября 2023 года N 580)
2.17. Отдел (отделение, группа) специального учета.
2.18. Отдел специального назначения.
2.19. Отдел (отделение) организации службы охраны.
2.20. Отдел (отделение) инженерно-технического обеспечения, связи, информатизации и вооружения.
2.21. Отдел (отделение) кадров.
2.22. Отдел (отделение, группа) профессиональной и служебной подготовки.
2.23. Отдел (отделение, группа) воспитательной и социальной работы с личным составом.
2.24. Отдел (отделение) организации работы по профилактике коррупционных и иных правонарушений (Инспекция по личному составу и профилактике коррупционных правонарушений).
2.25. Отдел (отделение, группа) воспитательной и социальной работы с осужденными.
2.26. Психологическая служба.