1.1. Группа организационно-штатной работы.
1.2. Юридическая служба.
1.3. Группа по организации мобилизационной подготовки и гражданской обороны.
1.4. Экспертная группа по вопросам безопасности.
1.5. Управление собственной безопасности.
1.6. Отдел документационного обеспечения и архивной работы (секретариат).
1.7. Отдел по защите государственной тайны.
1.8. Контрольно-ревизионный отдел (отделение).
1.9. Регионально-аналитическая группа (создается в ГУФСИН России по Приморскому краю, Нижегородской, Новосибирской, Ростовской и Свердловской областям).
1.10. Организационно-аналитический отдел.
1.11. Пресс-служба.
1.12. Ветеринарная служба.
1.13. Кустовая инспекция технического надзора.
1.14. Оперативное управление.
1.15. Отдел режима и надзора.
1.16. Отдел (отделение) организации исполнения наказаний, не связанных с изоляцией осужденных от общества.
1.16(1). Отдел исполнительной и постпенитенциарной пробации.
(Пункт дополниительно включен с 27 октября 2023 года приказом ФСИН России от 20 сентября 2023 года N 580)
1.17. Отдел (отделение) специального учета.
1.18. Отдел специального назначения.
1.19. Отдел организации службы охраны.
1.20. Отдел (отделение) инженерно-технического обеспечения, связи, информатизации и вооружения.
1.21. Отдел кадров.
1.22. Отдел (отделение, группа) профессиональной и служебной подготовки.
1.23. Отдел (отделение, группа) воспитательной и социальной работы с личным составом.
1.24. Отдел (отделение) организации работы по профилактике коррупционных и иных правонарушений (Инспекция по личному составу и профилактике коррупционных правонарушений).
1.25. Отдел (отделение) воспитательной и социальной работы с осужденными.
1.26. Психологическая служба.