Для достижения целей и задач государственной программы предусмотрена реализация шести подпрограмм:
1. Планирование экономического и социального развития территорий Санкт-Петербурга (далее - подпрограмма 1).
2. Сохранение и развитие исторического центра Санкт-Петербурга (далее - подпрограмма 2).
3. Развитие г.Кронштадта (далее - подпрограмма 3).
4. Формирование благоприятных условий развития экономики Санкт-Петербурга (далее - подпрограмма 4).
5. Повышение инвестиционной привлекательности Санкт-Петербурга (далее - подпрограмма 5).
6. Приобретение в государственную собственность Санкт-Петербурга объектов недвижимого имущества, в том числе объектов социальной инфраструктуры, строительство которых осуществляется с привлечением внебюджетных источников (далее - подпрограмма 6).
Подпрограмма 1 направлена на повышение качества и эффективности пространственного планирования Санкт-Петербурга, дальнейшее развитие градостроительной политики Санкт-Петербурга, определение приоритетов пространственного развития, формирование и развитие территорий, в том числе путем обеспечения их соответствующей градостроительной документацией.
Подпрограмма 2 направлена на создание условий для обеспечения сбалансированного социально-экономического развития исторического центра Санкт-Петербурга и повышения его инвестиционной привлекательности.
Подпрограмма 3 направлена на создание условий для обеспечения сбалансированного социально-экономического развития территории г.Кронштадта (о.Котлин).
Подпрограмма 4 направлена на повышение эффективности функционирования экономики Санкт-Петербурга для достижения целей социально-экономического развития Санкт-Петербурга.
Подпрограмма 5 направлена на создание условий для улучшения инвестиционного климата Санкт-Петербурга и привлечения инвестиционных ресурсов в приоритетные отрасли экономики.
Подпрограмма 6 направлена на приобретение в государственную собственность Санкт-Петербурга объектов недвижимого имущества, в том числе объектов социальной инфраструктуры.