Министерство осуществляет общую координацию и мониторинг реализации программных мероприятий, анализирует ход выполнения адресной программы и в случае необходимости вносит предложения по ее корректировке, проводит совещания с представителями органов местного самоуправления.
В целях обеспечения контроля за ходом реализации адресной программы муниципальные образования - участники программных мероприятий представляют в Министерство раздельно по каждому ее этапу отчетность в порядке, сроки и по формам, установленным соглашением и Фондом.
Министерство и органы государственного финансового контроля Самарской области в отношении органов местного самоуправления проводят обязательные проверки в части соблюдения условий, целей и порядка предоставления субсидий.