Управление реализацией Программы в целом возложено на министерство социального развития, опеки и попечительства Иркутской области, включая координацию деятельности соисполнителей Программы.
Соисполнители Программы направляют в министерство социального развития, опеки и попечительства Иркутской области отчеты о реализации мероприятий Программы, осуществляют подготовку предложений по корректировке Программы на следующий календарный год.
Контроль за выполнением целевых показателей Программы, своевременным и эффективным использованием средств областного и федерального бюджетов, направленных на финансирование мероприятий Программы, и соблюдением финансовой дисциплины при освоении финансовых средств осуществляется в соответствии с бюджетным законодательством исполнительными органами государственной власти Иркутской области, ответственными за реализацию мероприятий Программы.