4.1. Министерство возглавляет министр транспорта и дорожного хозяйства Амурской области (далее - министр), замещающий государственную должность Амурской области, назначаемый на должность и освобождаемый от должности губернатором Амурской области.
4.2. Министр имеет заместителей министра, которые назначаются на должность и освобождаются от должности губернатором Амурской области.
4.3. В период отсутствия министра его обязанности исполняет один из заместителей министра или иной государственный гражданский служащий министерства на основании распоряжения губернатора Амурской области.
4.4. Финансирование расходов, связанных с выполнением возложенных на министра полномочий, за исключением выплаты денежного вознаграждения, а также возмещения расходов, связанных с направлением министра в служебную командировку, осуществляется за счет ассигнований, предусмотренных в областном бюджете на содержание аппарата министерства.
4.5. Министр:
1) осуществляет общее руководство министерством на основе единоначалия и несет персональную ответственность за выполнение возложенных на министерство задач и полномочий;
2) утверждает структуру, штатное расписание министерства в пределах установленной Правительством Амурской области численности и фонда оплаты труда, положения о структурных подразделениях министерства, должностные регламенты и должностные инструкции, а также бюджетную смету министерства в соответствии с законом об областном бюджете;
3) осуществляет полномочия представителя нанимателя и работодателя в отношении государственных гражданских служащих и работников министерства в соответствии с законодательством, в том числе распределяет обязанности между своими заместителями, иными государственными гражданскими служащими и работниками министерства, устанавливает их ответственность;
4) обеспечивает исполнение законодательства о государственной гражданской службе и трудового законодательства в министерстве;
5) подписывает приказы министерства;
6) вносит на рассмотрение губернатора Амурской области и Правительства Амурской области проекты правовых актов по вопросам, входящим в компетенцию министерства;
7) учреждает Почетную грамоту министерства и Благодарность министра в целях поощрения граждан за высокие достижения в сферах деятельности министерства;
8) представляет особо отличившихся государственных гражданских служащих и работников министерства к присвоению почетных званий и награждению государственными наградами Российской Федерации, наградами губернатора Амурской области и Правительства Амурской области;
9) открывает и закрывает счета в соответствии с законодательством, совершает по ним операции, подписывает финансовые документы;