В современном состоянии биоразнообразия территории Самарской области отчетливо выделяются специфические черты, детерминированные особенностями ее природно-исторического развития и длительной разноплановой антропогенной трансформацией всех типов природных экосистем.
Положение Самарской области на границе двух природных зон - лесостепной и степной, в переходной полосе от Европы к Азии, а также многообразие элементов рельефа, подстилающих пород, режима увлажнения, почвенных условий в совокупности определяют широкую представленность экотонов (пространств перехода между различными типами экосистем), что обуславливает высокую степень разнообразия флоры и фауны.
История геологического развития территории, в которой неоднократно прослеживались вызванные кардинальной сменой климата изменения растительного покрова от богатой тропической до бедной плейстоценовой флор, способствовала сохранению во флоре региона целого ряда реликтов различных исторических эпох, но наряду с этим естественным образом происходила утрата еще большего числа видов. Достаточно высока доля эндемиков с различной широтой ареала.
Воздействие антропогенного фактора, начавшееся 3 - 4 тыс. лет назад, неуклонно возраставшее и достигшее максимальной выраженности в XIX - XX веках, в значительной мере обусловило появление обширных безлесных пространств с фрагментами островных лесов. Южная граница степи, а также лесостепи и широколиственных лесов вследствие антропогенного воздействия отступили далеко на север. На месте пространств, ранее занятых лесостепью, сформировались массивы типчаково-ковыльных и разнотравно-ковыльных степей. В дальнейшем все типы природных сообществ, представленные в пределах территории Самарской области, подверглись глубокой антропогенной трансформации, что сильнее всего отразилось на степных экосистемах, в подавляющем большинстве превращенных в пахотные угодья.
Развитие масштабного индустриально-энергетического и транспортного комплекса, включающего Жигулевскую ГЭС, ряд крупнейших предприятий химии и нефтехимии, металлообработки, машиностроения, системы трубопроводов и линий электропередач, воздушного, водного и наземного транспорта, привело к многократному усилению прямого и косвенного техногенного воздействия на природные экосистемы.
Остаточный характер сохранившихся природных экосистем, которые являются очагами биологического разнообразия, определяет их уязвимость и повышает значимость мер, направленных на их сохранение. Природные экосистемы продолжают выполнять свою роль в качестве источника экосистемных услуг, однако их эксплуатация без должных учета и регулирования может в ближайшем будущем привести к необратимой утрате ими своих свойств.
Прогнозируемые сценарии глобальных климатических изменений, широко обсуждаемые в последнее время, заставляют рассматривать возможные тренды трансформации компонентов биоразнообразия Самарской области с учетом возможных направлений естественного сукцессионного саморазвития природных экосистем и перспектив их антропогенного регулирования.