Для предотвращения возникновения и распространения НКИ в условиях стационара "зеленая зона" издан Приказ БУ РК "Республиканская больница им. П.П. Жемчуева" от 07.12.2020 N 2254 "Об организации фильтр-палаты в "зеленой зоне" стационара". Организованы фильтр-палаты для пациентов терапевтического и хирургического профиля с подозрением на коронавирусную инфекцию на 1 этаже терапевтического корпуса. После получения отрицательного НФ-мазка пациент переводится в профильное отделение. Больные с острым инфарктом миокарда и с сердечно-сосудистыми заболеваниями, состоянием угрожающим жизни, госпитализируются в блок интенсивной терапии, который организован по типу изолированных боксов, в том числе после проведенных экстренных чрескожных вмешательств, согласно маршрутизации больных с ОКС.
В структуру инфекционного госпиталя N 3, расположенного в хирургическом корпусе БУ РК "Республиканская больница им. П.П. Жемчуева", входит инфекционно-диагностическое отделение на 30 коек (ранее 50 коек).