Охраняемые природные комплексы и их компоненты, расположенные в границах заказника, представлены участком реки Вычегды с нерестоохранными полосами лесов по обоим ее берегам. Ширина русла реки Вычегда на данном участке составляет от 100 м до 280 м, глубина - 5 - 7 м. Дно песчано-галечное.
Видовой состав рыб, обитающих в заказнике, отражает практически все разнообразие рыбного населения среднего течения р. Вычегда. В состав ихтиофауны включены 20 - 22 вида проходных рыб, совершающих нерестовые миграции. Большинство видов рыб, обитающих в заказнике, относятся к промысловым видам. Несомненными доминантами по численности являются плотва, окунь, лещ, язь, ерш обыкновенный и щука обыкновенная.
Наиболее ценные в промысловом отношении рыбы, включенные в отряд лососеобразные, представлены четырьмя видами (хариус европейский (Thymallus thymallus), нельма (Stenodus leucichthys nelma), сиг-пыжьян (Coregonus pidschian) и лосось атлантический (Salmo salar)). Отряд осетрообразных, определяющий функциональное назначение заказника, представлен видом - стерлядь (Acipenser ruthenus).
Большинство видов входит в группу весенне-нерестующих рыб. К осенне-нерестующим видам относятся атлантический лосось, нельма и сиг-пыжьян. Единственным видом, который нерестится зимой, в декабре - феврале, является налим (Lota lota).
Стерлядь (Acipenser ruthenus), для поддержания численности и сохранения воспроизводства которой создан заказник, откладывает икру в конце мая - начале июня на гравелистых субстратах быстрых глубоких плесов.
Нельма, обитающая на территории заказника, занесена в Красную книгу Республики Коми (2019). На территории заказника отмечен также подкаменщик обыкновенный (Cottus gobio), внесенный в Перечень (список) объектов животного мира, нуждающихся в особом внимании к их состоянию в природной среде и рекомендованных для биологического надзора, утвержденный приказом Министерства природных ресурсов и охраны окружающей среды Республики Коми от 27 марта 2019 г. N 498.
В прирусловой части поймы небольшие пространства покрывают заросли кустарников и смешанные елово-березовые бруснично-зеленомошные леса, произрастающие на аллювиальных дерново-луговых (лесных) почвах. В более влажных условиях преобладают ельники травяно-зеленомошные на аллювиальных лугово-болотных (лесных) оторфованных почвах. Наибольшую площадь в резервате занимают пойменные травяно-сфагновые и хвощево-сфагновые ельники, которые развиваются на болотных низинных перегнойно-торфяно-глеевых почвах. Для этих сообществ характерен сложный микрорельеф - обилие валежа, чередование пристволовых повышений с заболоченными сфагновыми мочажинами, к которым приурочены болотные растения: осоки, хвощ топяной (Equisetum fluviatile), вахта трехлистная (Menyanthes trifoliata), сабельник болотный (Comarum palustre) и др.
Особенностью заказника является обилие представителей семейства орхидные.
На территории заказника отмечены виды сосудистых растений, подлежащих охране или нуждающихся в биологическом надзоре. В 1980-е гг. здесь были найдены отдельные экземпляры зимолюбки зонтичной (Chimaphila umbellata), в устье р. Вуктыл - истода хохлатого (Polygala comosa). Основным объектом охраны в резервате являются редкие северные орхидеи. Венерин башмачок настоящий (Cypripedium calceolus), пальчатокоренник Траунштейнера (Dactylorhiza traunsteineri) - занесены в Красную книгу РФ (2018) и Красную книгу Республики Коми (2019), а также башмачок пятнистый (Cypripedium guttatum), дремлик широколистный (Epipactis helleborine) - занесены в Красную книгу Республики Коми (2019). Любка двулистная (Platanthera bifolia), кокушник комарниковый (Gymnadenia conopsea) - внесены в Перечень (список) объектов животного мира, нуждающихся в особом внимании к их состоянию в природной среде и рекомендованных для биологического надзора, утвержденный приказом Министерства природных ресурсов и охраны окружающей среды Республики Коми от 27 марта 2019 г. N 498 (приложение N 4).
В заказнике охраняются следующие типы ландшафтов - болота таежной зоны и поймы крупных рек.
Почвы болотные низинные перегно-глеевые на песчаниках.
Коренные породы территории представлены песчаниками, алевролитами, аргиллитами, углями, конгломератами, известняками, сидеритовыми конкрециями, разнофациальными терригенными и терригенно-карбонатными отложениями верхнего отдела пермской системы (татарский ярус).