Комплексное управление Программой осуществляется субъектом бюджетного планирования - Минсельхозпродом Республики Мордовия.
Система управления реализацией Программы:
- ответственными за реализацию Программы являются Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республики Мордовия и Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия;
- финансирование программных мероприятий осуществляет отдел финансов, бухгалтерского учета и отчетности Минсельхозпрода Республики Мордовия и Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия;
- мониторинг реализации программы осуществляет Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия и отдел развития отраслей животноводства и племенного дела Минсельхозпрода Республики Мордовия.
Реализация мероприятий Программы будет осуществляться во взаимодействии со следующими органами исполнительной власти Республики Мордовия:
- Министерство лесного, охотничьего хозяйства и природопользования Республики Мордовия;
- Министерство финансов Республики Мордовия;
- Министерство экономики, торговли и предпринимательства Республики Мордовия;
- Администрации муниципальных образований Республики Мордовия.
Программа предполагает взаимодействие с федеральными органами исполнительной власти:
- Управление Россельхознадзора по Республике Мордовия и Пензенской области;
- Министерство внутренних дел по Республике Мордовия;
- Главное управление МЧС России по Республике Мордовия;