Подпрограммы государственной программы предусматривают комплекс взаимосвязанных мер, направленных на достижение целей государственной программы, а также на решение наиболее важных текущих и перспективных задач, обеспечивающих продовольственную независимость области, поступательное социально-экономическое развитие агропромышленного комплекса на основе его модернизации, устойчивое развитие сельских территорий и позитивное влияние на макроэкономические показатели области.
Государственная программа состоит из 13 подпрограмм, разработанных с учетом положений Государственной программы развития сельского хозяйства и регулирования рынков сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия, утвержденной постановлением Правительства Российской Федерации от 14 июля 2012 г. N 717:
1. Подпрограмма 1 "Развитие подотрасли растениеводства, переработки и реализации продукции растениеводства".
2. Подпрограмма 2 "Развитие мелиорации сельскохозяйственных земель области".
3. Подпрограмма 3 "Развитие подотрасли животноводства, переработки и реализации продукции животноводства".
4. Подпрограмма 4 "Развитие мясного скотоводства".
5. Подпрограмма 5 "Обеспечение эпизоотического и ветеринарно-санитарного благополучия на территории области".
6. Подпрограмма 6 "Поддержка малых форм хозяйствования".
7. Подпрограмма 7 "Техническая и технологическая модернизация, инновационное развитие".
8. Подпрограмма 8 "Устойчивое развитие сельских территорий".
9. Подпрограмма 9 "Обеспечение реализации основных направлений государственной политики в сфере реализации государственной программы".
10. Подпрограмма 10 "Развитие овощеводства открытого и защищенного грунта и семенного картофелеводства".
11. Подпрограмма 11 "Развитие молочного скотоводства".
12. Подпрограмма 12 "Поддержка племенного дела, селекции и семеноводства".