Источниками финансирования Программы являются федеральный бюджет, бюджет Республики Крым, внебюджетные источники, привлечение средств местных бюджетов не планируется. На финансирование Программы предполагается направить средства в сумме 9550064,455 тыс. руб., в т.ч.:
федеральный бюджет - 2839565,901 тыс. руб. (2018 г. - 265728,1 тыс. руб., 2019 г. - 350687,8 тыс. руб., 2020 г. - 319724,6 тыс. руб., 2021 г. - 667150,751 тыс. руб., 2022 г. - 1003097,95 тыс. руб., 2023 г. - 233176,7 тыс. руб.);
бюджет Республики Крым - 5456894,983 тыс. руб. (2018 г. - 811241,641 тыс. руб., 2019 г. - 920225,739 тыс. руб., 2020 г. - 929943,11 тыс. руб., 2021 г. - 931714,099 тыс. руб., 2022 г. - 931898,65 тыс. руб., 2023 г. - 931871,744 тыс. руб.);
внебюджетные средства - 1253603,571 тыс. руб. (2018 г. - 5143,441 тыс. руб., 2019 г. - 140714,53 тыс. руб., 2020 г. - 377311,119 тыс. руб., 2021 г. - 593817,581 тыс. руб., 2022 г. - 86616,9 тыс. руб., 2023 г. - 50000,0 тыс. руб.).
Объем финансирования Программы за счет средств федерального бюджета и бюджета Республики Крым ежегодно уточняется в соответствии с федеральным законом о федеральном бюджете на соответствующий финансовый год и плановый период и законом Республики Крым о бюджете Республики Крым на соответствующий финансовый год и плановый период. Объем финансирования в разрезе мероприятий Программы приведен в приложении 5 к Программе.
Порядок предоставления и распределения субсидии из бюджета Республики Крым бюджетам муниципальных образований Республики Крым на реализацию мероприятий федерального проекта "Чистая страна", реализуемого в рамках национального проекта "Экология" приведен в приложении 6 к Программе.