Городской округ "город Якутск" расположен в долине Туймаада на левом берегу реки Лена, в среднем ее течении. Общая площадь городского округа "город Якутск" составляет 3,6 тыс. кв. км, занимая только 0,1% территории Республики Саха (Якутия). Находится несколько севернее параллели 62 градуса северной широты, вследствие чего в летнее время наблюдается длительный период "белых ночей", а зимой (в декабре) - светлое время суток длится всего 3 - 4 часа.
Границы территорий городского округа "город Якутск" утверждены Законом Республики Саха (Якутия) от 30 ноября 2004 года 174-З N 355-III "Об установлении границ территорий и о наделении статусом городского округа муниципальных образований Республики Саха (Якутия)", согласно которому городской округ "город Якутск" состоит из 15 административных территорий:
- Автодорожный округ города Якутска;
- Гагаринский округ города Якутска;
- Губинский округ города Якутска;
- Октябрьский округ города Якутска;
- Промышленный округ города Якутска;
- Сайсарский округ города Якутска;
- Строительный округ города Якутска;
- Центральный округ города Якутска;
- микрорайон Кангалассы;
- микрорайон Марха;
- село Маган;
- село Пригородное;