На водораздельных пространствах заказника распространены преимущественно еловые леса зеленомошного типа. Надпойменные террасы заняты в основном еловыми, елово-березовыми и березово-еловыми, кустарничково-хвощево-зеленомошными и кустарничково-папоротничково-зеленомошными сообществами с хорошо развитым напочвенным покровом. Их характерной особенностью является господство черники (Vaccinium myrtillus) в травяно-кустарничковом покрове. Из других растений можно отметить бруснику (Vaccinium vitis-idaea), майник двулистный (Maianthemum bifolium), хвощ лесной (Equisetum sylvaticum). Значительную часть территории заказника занимают заболоченные еловые леса, главным образом долгомошные и сфагновые. Ельники долгомошные произрастают на участках плоских понижений водораздельных пространств с застойным увлажнением и на пологих склонах.
В местах с избыточно влажными и бедными питательными веществами почвами формируются благоприятные условия для развития в напочвенном покрове сфагновых мхов. Здесь развиты ельники сфагновые. Сосновые и березовые (Betula pubescens, Betula pendula) древостои занимают меньшие площади. На песчаных боровых террасах рек распространены сосняки кустарничково-лишайниковые.
Заказник располагается в подзонах средней и частично северной тайги, в пределах Удорского елового и Средне-Тиманского елово-лиственничного геоботанических округов.
Почвы таких местообитаний бедные и сухие, поэтому видовой состав растений не отличается высоким разнообразием. Из кустарничков наиболее обычны брусника и водяника обоеполая (Empetrum hermaphroditum). Облик нижних ярусов определяют кустистые лишайники из рода кладония, среди которых встречаются пятна зеленых мхов. На аллювиальных наносах по крутым берегам притоков реки Мезень часто формируются березо-еловые леса высокотравные или разнотравные. Болота на территории заказника небольшие по площади, часто облесены березой или елью. На Четласском камне встречаются насаждения, в которых по запасу доминирует лиственница.
На территории заказника в долинах Мезени, Визинги и Нижней Пузлы на выходах известняков произрастают многие специфические виды, характерные для обнажений горных пород Тимана и Урала. На мелкоземе в трещинах скал отмечены типичные кальцефилы. Пойменные и скальные экотопы на территории заказника важны как местообитания редких и охраняемых видов.
Географический анализ показал, что среди широтных групп наибольшее участие во флоре заказника принимает бореальная флора (Matteuccia struthiopteris, Allium schoenoprasum, Hieracium altipes и др.). Видов этой группы более 70%, что характерно для некоторых флор подзоны северной тайги.
Проведенные исследования показали, что систематическая, географическая, ценотическая и биологическая структуры флоры заказника в целом являются типичными для зоны северной тайги Северо-Востока европейской части России. При этом у нее имеется ряд особенностей. Первое место среди ведущих семейств занимает сем. Осоковые. Происходит увеличение доли видов северных широтных групп, что связано с северным положением резервата в зоне тайги и присутствием на его территории скальных обнажений. Голарктическая и евразиатская долготные группы имеют почти одинаковое число видов, как и во всей флоре таежной зоны Республики Коми. Влияние сибирской флоры на разнообразие видов невелико, однако доминирующие хвойные породы - сибирские. Флора заказника испытывает слабое антропогенное воздействие, число видов полизональной широтной, космополитной долготной и сорной ценотической групп здесь невелико. Данная территория является в значительной степени заболоченной и обводненной, здесь выявлено большое количество водных и болотных растений.
Во флоре сосудистых растений зарегистрировано порядка 340 видов. Среди них таксоны, которые занесены в Красную книгу Республики Коми (2019): вудсия эльбская (Woodsia ilvensis), многоножка обыкновенная (Polypodium vulgare), осока птиценожковая (Carex ornithopoda), пальчатокоренник мясо-красный (Dactylorhiza incarnata), пальчатокоренник Траунштейнера (Dactylorhiza traunsteineri), дремлик темно-красный (Epipactis atrorubens), леукорхис беловатый (Leucorchis albida), пион уклоняющийся (Paeonia anomala), родиола розовая (Rhodiola rosea), кизильник черноплодный (Cotoneaster melanocarpus), копеечник альпийский (Hedysarum alpinum). Два вида - пальчатокоренник Фукса (Dactylorhiza fuchsii) и кокушник комариный (Gymnadenia conopsea) - включены в Перечень (список) объектов растительного мира, нуждающихся в особом внимании к их состоянию в природной среде и рекомендованных для биологического надзора, утвержденный приказом Министерства природных ресурсов и охраны окружающей среды Республики Коми от 27 марта 2019 г. N 498 (приложение N 3). Большинство редких видов приурочено к выходам известняков Тимана. На территории комплексного заказника обнаружено 96 видов листостебельных мхов и 168 видов лишайников. В резервате выявлено 125 видов трутовых грибов, в том числе один вид (губка лиственничная (Fomitopsis officinalis)), занесенный в Красную книгу Республики Коми (2019). Такие из них, как амолоцистис лапландский (Amylocyctis lapponica) и скелетокутис звездчатый (Skeletocutis stellae) являются одними из важнейших индикаторов девственных лесов.
В состав заказника входит участок реки Мезень (от устья реки Уджью до истоков) с ее притоками, в том числе Елва-Мезенская, Нижняя Пузла и Верхняя Пузла, являющиеся местом нереста лосося атлантического (согласно правилам рыболовства для Северного рыбохозяйственного бассейна, утвержденным приказом Министерства сельского хозяйства Российской Федерации от 30 октября 2014 г. N 414), который внесен в Перечень (список) объектов животного мира, нуждающихся в особом внимании к их состоянию в природной среде и рекомендованных для биологического надзора, утвержденный приказом Министерства природных ресурсов и охраны окружающей среды Республики Коми от 27 марта 2019 г. N 498 (приложение N 4).
Фауна рыб неоднородна, что обусловлено гидрологическим режимом, свойственным горным и полугорным водотокам. Доминирует бореальный предгорный фаунистический комплекс, включающий европейского хариуса (Thymallus thymallus), речного гольяна (Phoxinus phoxinus), усатого гольца (Barbatulus barbatulus), атлантического лосося и обыкновенного подкаменщика (Cottus gobio), который внесен в Перечень (список) объектов животного мира, нуждающихся в особом внимании к их состоянию в природной среде и рекомендованных для биологического надзора, утвержденный приказом Министерства природных ресурсов и охраны окружающей среды Республики Коми от 27 марта 2019 г. N 498 (приложение N 4), и в Красную книгу Российской Федерации (2001). Немногочисленны сиг-пыжьян (Coregonus pidschian), елец (Leuciscus rutilus), пескарь (Gobio gobio), щука обыкновенная (Esox lucius) и окунь обыкновенный (Perca fluviatilis). По опросным данным, здесь зафиксированы речная камбала (Platichthys flesus) и налим (Lota lota).
На территории заказника обитают 16 видов стрекоз, 51 вид клопов, 28 видов бабочек. Позвоночные представлены более чем 130 видами. Основу местной орнитофауны составляют сибирские виды птиц. Местные млекопитающие представлены 36 видами, из них наибольший интерес вызывает северный олень (Rangifer tarandus), который занесен в Красную книгу Республики Коми (2019).