Город Ярославль занимает ведущее место в структуре научно-инновационного потенциала Ярославской области. Число организаций города, внедряющих инновации, составляет около 60% от общего количества таких организаций в области.
Затраты на инновации организаций города Ярославля в 2018 году упали в 3,7 раза к уровню 2014 года и составили 2 млрд. руб. На этом фоне доля отгруженной инновационной продукции уверенно росла в 2015 - 2018 годах и была равна в 2018 году 16,4% от общего объема отгруженной продукции.
В городе Ярославле 27 организаций осуществляют научно-исследовательскую деятельность. Более половины из них (52%) составляют высшие учебные заведения.
К крупнейшим вузам города Ярославля относятся ЯрГУ, ЯГПУ, ЯГМУ, ЯГТУ.
Развитие фундаментальной науки является первоочередной задачей ЯрГУ. Совместно с Ярославским филиалом Физико-технологического института Российской академии наук, специализирующимся на проведении фундаментальных и прикладных исследований в области элементной и технологической базы микро-наноэлектроники и микросистемной техники, университет образовал Центр коллективного пользования "Диагностика микро- и наноструктур", в рамках которого осуществляются научные исследования для фармацевтического кластера Ярославской области. В ЯрГУ действуют две базовые кафедры, образовательная деятельность которых связана с цифровыми технологиями: кафедра разработки облачных сервисов и кафедра разработки цифровых платформ для государственного управления.
ЯГПУ - это еще один научный центр города, в котором ведется научно-исследовательская работа и осуществляются фундаментальные исследования. В рамках реализации Федеральной целевой программы по развитию фармацевтической и медицинской промышленности на базе ЯГПУ реализован проект по созданию центра трансфера технологий, разработки инновационных и импортозамещающих лекарственных средств и подготовки кадров для фармацевтической промышленности.
В ЯГМУ ведется научная деятельность по направлениям, посвященным фармацевтической технологии и разработке новых лекарственных форм. Фармацевтический факультет университета активно взаимодействует с предприятиями, входящими в состав кластера фармацевтической промышленности и инновационной медицины.
Среди основных направлений научных исследований ЯГТУ можно выделить:
- теоретические и экспериментальные исследования закономерностей синтеза органических соединений многоцелевого назначения;
- разработка методов получения полимеров с новыми свойствами;
- совершенствование конструкции, технико-экономических и экологических характеристик поршневых двигателей;
- автоматизация и управление технологическими процессами и производствами;
- компьютерно-интегрированное машиностроение.
В городе Ярославле с 2019 года реализуется проект по созданию базовых школ РАН. Цель проекта - создание благоприятных условий для выявления и обучения талантливых детей, их ориентации на построение успешной карьеры в области науки и высоких технологий. Базовыми школами РАН в городе определены: