2.1. Целью создания заказника является сохранение и восстановление ценных водных объектов и экологических систем, а также прилегающих участков суши, обеспечивающих оптимальный гидрологический баланс.
2.2. Задачи заказника:
сохранение гидрологических объектов: озера Чембурского и Анапских плавней, в том числе сохранение свойств и качества водных объектов для воспроизводства рыбных запасов;
поддержание естественных природных процессов, происходящих в плавневой зоне Черноморского побережья;
сохранение условий для миграции и зимовки перелетных птиц;
обеспечение охраны и создание условий для воспроизводства редких и исчезающих объектов животного и растительного мира;
создание условий для регулируемого рекреационного и познавательного туризма, ведения экологического мониторинга, научно-исследовательских работ, эколого-образовательной и просветительской деятельности.