Программа содержит мероприятия, направленные на решение приоритетных задач в сфере природопользования и охраны окружающей среды на территории Алтайского края, осуществление которых будет способствовать обеспечению экологической безопасности, устойчивому функционированию естественных экологических систем, сохранению биоразнообразия, актуализации баланса запасов и кадастра месторождений общераспространенных полезных ископаемых Алтайского края, защите территорий и населения Алтайского края от негативного воздействия вод, обеспечению безопасности гидротехнических сооружений (далее - ГТС), оздоровлению экологической обстановки на водных объектах, созданию условий для повышения эффективности использования природных ресурсов края.