Охраняемый природный комплекс заказника представлен обширной олигомезотрофной болотной системой, состоящей из нескольких верховых массивов, разделенных переходными осоково-сфагновыми участками и транзитными топями. Для верховых массивов характерны слабовыпуклая поверхность, пологий склон и комплексный растительный покров. Преобладают кочковато-топяные комплексы, в центре переходящие в грядово-мочажинные. Основу растительности составляют вересковые болотные кустарнички, болотные травянистые растения и сфагновые мхи. На окраине и по периферии массивов преобладают повышенные формы микрорельефа, а в центре - топи и мочажины. Несмотря на то, что сосна обыкновенная (Pinus sylvestris) встречается повсеместно, ярус она образует редко и приурочена исключительно к микроповышениям. Травяно-кустарничковый ярус на кочках густой, хорошо выражен, общее проективное покрытие составляет 50 - 80%. В большинстве случаев в травяно-кустарничковом ярусе обильны сразу несколько видов кустарничков, таких как кассандра болотная (Chamaedaphne calyculata), багульник болотный (Ledum palustre), голубика обыкновенная (Vaccinium uliginosum), водяника обоеполая (Empetrum hermaphroditum) и подбел узколистный (Andromeda polifolia). Из трав обильна только морошка (Rubus chamaemorus). В небольшом обилии здесь произрастают росянка круглолистная (Drosera rotundifolia), осока малоцветковая (Carex pauciflora), пушица влагалищная (Eriophorum vaginatum) и клюква мелкоплодная (Oxycoccus microcarpus). В напочвенном покрове кочек повсеместно господствует сфагнум бурый (Sphagnum fuscum). Единично отмечены лишайники. Топи и мочажины топкие, местами сильно обводнены. Доминантами травяно-кустарничкового яруса являются шейхцерия болотная (Scheuchzeria palustris), осока топяная (Carex limosa), реже пушица рыжеватая (Eriophorum russeolum) и п. влагалищная (Eriophorum vaginatum), единично произрастают росянка английская (Drosera anglica), р. круглолистная, клюква болотная (Oxycoccus palustris) и подбел узколистный. В моховом покрове господствуют гигрофильные сфагны: с. балтийский (Sphagnum balticum), с. Линдберга (Sphagnum lindbergii) и с. большой (Sphagnum molle).
Небольшие площади в пределах заказника занимают мезотрофные участки и минеротрофные окраинные и транзитные топи. К первым приурочены характерные для переходных болот осоково-сфагновые фитоценозы с господством в травяно-кустарничковом ярусе осоки бутыльчатой (Carex rostrata), в напочвенном покрове - сфагнума изменчивого (Sphagnum fallax). Ко вторым - вахтово-сфагновые, вахтово-осоково-сфагновые, вахтовые и травяно-сфагновые сообщества. В топях наряду с олиготрофными появляются и даже занимают господствующее положение растения, требовательные к условиям водно-минерального питания: хвощ топяной (Equisetum fluviatile), вахта трехлистная (Menyanthes trifoliata), сабельник болотный (Comarum palustre) и др.