Выполнение Программы осуществляется путем реализации следующих подпрограмм:
- подпрограмма "Организация транспортного обслуживания населения городского округа город Уфа Республики Башкортостан" предполагает сохранение стабильного уровня пассажирских перевозок транспортом и улучшению качества предоставляемых услуг;
- подпрограмма "Развитие городского наземного электротранспорта в городском округе город Уфа Республики Башкортостан" предполагает повышение надежности, доступности, комфортности и безопасности перевозок пассажиров и багажа городским наземным электротранспортом на муниципальных маршрутах регулярных перевозок в городском округе город Уфа Республики Башкортостан.